بدأت العلاقات الدبلوماسية بين البحرين واليابان منذ 51 عامًا في مايو 1972. تراجع حجم التجارة بين البحرين واليابان بنسبة %19 بين عامي 2018 و2022 حيث بلغ حجم التبادل التجاري بين البلدين 669 مليون دولار بنهاية 2022، إلا أن صادرات البحرين إلى اليابان زادت بنسبة %431 خلال هذه الفترة. توجد العديد من فرص الاستثمار والتعاون بين البلدين في عدد من القطاعات الواعدة كعلم الأحياء والبيئة والطاقة والصناعة، والسياحة، وتكنولوجيا، المعلومات ،والاتصالات.
